L'ASCOBANS a été conclu en 1991 en tant qu'Accord sur la conservation des petits cétacés de la mer Baltique et de la mer du Nord (ASCOBANS) sous les auspices de la Convention sur les espèces migratrices (CMS ou Convention de Bonn) et est entré en vigueur en 1994. En février 2008, une extension de la zone de l'accord est entrée en vigueur, qui a changé le nom en « Accord sur la conservation des petits cétacés de la mer Baltique, de l'Atlantique du Nord-Est, de la mer d'Irlande et de la mer du Nord ».