Die Auswirkungen der Freizeitfischerei auf See auf Fischbestände oder andere Elemente der biologischen Vielfalt der Meere wurden noch nicht bewertet. Gegenwärtig ist die Freizeitfischerei mit Kiemennetzen auf See verboten, um den Beifang von Vogel- und Meeressäugetieren einzuschränken. Im Schutzgebiet „Vlaamse Banken“, das etwa ein Drittel des belgischen Teils der Nordsee abdeckt, ist jegliche Freizeitfischerei mit Fanggeräten, die den Boden stören, verboten.

Wo auch immer die Binnenfischerei stattfindet, sollte die Qualität des Ökosystems respektiert werden, indem unnötige, ineffiziente oder schädliche Fischbestände (Überbestände, mit anderen Gewässern verbundene Teiche usw.) vermieden werden. Erforderlichenfalls sollten bei der Anpflanzung einheimischer Fische die lokalen genetischen Stämme und die Populationsstruktur berücksichtigt werden. Populationen von Arten, die für die Fischerei nicht von Interesse sind, sollten respektiert werden. Bestände nicht einheimischer Arten sollten vermieden werden, um die Einschleppung und Ausbreitung invasiver gebietsfremder Arten zu verhindern. Das Eindringen heimischer Fischarten in Wildfischpopulationen sollte vermieden werden. Übermäßiges Ködern und die daraus resultierende Dystrophierung müssen vermieden werden, insbesondere in Seen und Stauseen. Darüber hinaus sollte die Überwachung dieser Aktivitäten verstärkt werden.

Die Planung und Wiederherstellung von Binnenwassersystemen sollte gefördert werden: Durch Biomanipulation kann die Fischerei zur Sanierung klarer Wassersysteme mit Makrophyten und hohem Artenreichtum beitragen, statt armer und banaler Trübwassersysteme, die durch Algenblüten gekennzeichnet sind. Bei der Bewirtschaftung von Fischbeständen sollte ein Gleichgewicht zwischen der Tragfähigkeit der aquatischen Ökosysteme und der Größe und Struktur der Fischpopulationen erreicht werden, um klare Wassersysteme zu fördern und Trübwassersysteme mit geringer Artenvielfalt zu verhindern. Die Bevorratung von Teichen sollte vermieden werden: Sie sind zu klein, um große Fischpopulationen aufzunehmen. Darüber hinaus sollten die Erhaltung und Anlage fischfreier Teiche für bestimmte Biota, beispielsweise Amphibien, gefördert werden.