Die Ziele des MARBENA-Projekts waren:

• Schaffung der Infrastruktur für die Erforschung der biologischen Vielfalt der Meere in Europa durch Schaffung eines paneuropäischen Netzwerks von Meereswissenschaftlern; Verbesserung der Wissenschaft durch Katalogisierung des vorhandenen Fachwissens und der vorhandenen Infrastruktur, Definition und Priorisierung der betreffenden Themen; Schaffung eines intellektuell attraktiven Umfelds für junge Wissenschaftler und eines Diskussionsforums für alle
• Sensibilisierung für die anstehenden Themen und Erhöhung der Sichtbarkeit der Meeresbiodiversitätsforschung in Europa: Kommunikation mit politischen Entscheidungsträgern und Politikern der EU (Präsentation der Themen der Meeresbiodiversität auf den Treffen der Strategie der Europäischen Plattform für Biodiversitätsforschung), Zusammenarbeit mit globalen Organisationen und Programmen und Verbreitung von Informationen an die breite Öffentlichkeit.