De Conferentie van de Partijen is het bestuursorgaan van het Verdrag en bevordert de uitvoering van het Verdrag door middel van de besluiten die zij neemt tijdens haar periodieke vergaderingen.

Tot op heden heeft de Conferentie van de Partijen 14 gewone vergaderingen gehouden, en één buitengewone vergadering (de laatste, om het Bioveiligheidsprotocol aan te nemen, werd in twee delen gehouden). Van 1994 tot 1996 hield de Conferentie van de Partijen jaarlijks haar gewone vergaderingen. Sindsdien zijn deze bijeenkomsten iets minder vaak gehouden en zullen ze, na een wijziging van het reglement van orde in 2000, nu om de twee jaar worden gehouden.

De vijftiende vergadering van de Conferentie van de Partijen (COP 15) zal worden gehouden in Kunming, China, datum nader te bevestigen.