Het Comité voor Milieubescherming (CEP) werd opgericht bij artikel 11 van het Milieuprotocol. Artikel 12 bepaalt dat het Comité tot taak heeft „advies te geven en aanbevelingen te formuleren aan de partijen in verband met de uitvoering van dit protocol, met inbegrip van de werking van de bijlagen, ter overweging tijdens adviesbijeenkomsten van het Antarctisch Verdrag”. De eerste vergadering van het Comité was in 1998.

Het comité bestaat uit vertegenwoordigers van de partijen bij het milieuprotocol en komt gewoonlijk eenmaal per jaar bijeen in samenwerking met de ATCM. De CEP-vergaderingen worden ook bijgewoond door verschillende waarnemers.