Le CEBIOS est un programme de l'Institut royal des sciences naturelles de Belgique (RBINS), dont il fait partie de la Direction opérationnelle « Nature ». Le CEBIOS fait partie du groupe « BIOPOLS » et est étroitement associé au point focal belge auprès de la Convention sur la diversité biologique (CBD).

Le programme CEBIOS renforce les capacités des partenaires de la coopération belge dans le domaine de la conservation de la biodiversité et de la gestion durable liée à l'éradication de la pauvreté. Il travaille dans le cadre des obligations internationales de la Belgique en vertu de la Convention sur la diversité biologique (CDB) et de la stratégie belge pour la biodiversité 2020.

Le programme CEBIOS est financé par la Direction générale de la coopération au développement (DGD) dans le cadre d'un protocole de coopération entre le ministère de la coopération au développement et le ministère de la politique scientifique.