La biodiversité est un enjeu majeur dans la région antarctique. La biodiversité de l'Antarctique est d'une valeur unique en raison de son état relativement vierge, avec son taux élevé d'espèces endémiques au caractère hautement adapté. La zone du Traité sur l'Antarctique présente un intérêt particulier en raison du haut niveau de coopération scientifique entre les pays.

Ces questions doivent être abordées de manière cohérente et coordonnée au sein de la CDB, de l'UNCLOS et des organes du système du Traité sur l'Antarctique (Comité pour la protection de l'environnement, Commission pour la conservation de la faune et de la flore marines de l'Antarctique - CCAMLR), en particulier en ce qui concerne les zones marines protégées et l'APA. Une attention particulière sera également accordée aux impacts humains sur les populations de cétacés de la région antarctique et, à cet égard, aux travaux de la Commission baleinière internationale.